RESUMO
Abstract Objectives: Evaluate the association between rifampicin resistance and the presence of at least one SNP in the rpoB and ponA1 genes and the spoligotype defined lineages. Material and Methods: This study analyzed two databases of 484 genomes of M. tuberculosis from strains isolated from patients in the cities of Lima and Callao, for which the odds ratio (OR) was calculated considering belonging to a certain spoligotype defined lineages as an exposure factor. Results: No statistically significant association (ρ value> 0.05) was found between the presence of at least one SNP in the rpoB gene and the lineages included in the study (LAM, Haarlem, T and Beijing). However, a statistically significant association was found between the presence of at least one SNP in the ponA1 gene and the LAM and Haarlem lineages (ρ value <0.05). An association was found between the P631S SNP in the ponA1 gene and the LAM and Haarlem lineages; and the A516T SNP, of this same gene, presented an association with the LAM lineage. Likewise, an association was found between rifampicin resistance and the LAM lineage. Conclusions: The presence of SNPs in the ponA1 gene is associated with the LAM and Haarlem lineages.
Resumen Objetivos: Evaluar la asociación entre la resistencia a rifampicina y la presencia de al menos un SNP en los genes rpoB y ponA1 y los linajes definidos por espoli gotipos. Material y Métodos: Este estudio analizó dos bases de datos de 484 genomas de M. tuberculosis de cepas aisladas de pacientes de las ciudades de Lima y Callao, para lo cual se calculó el odds ratio (OR) considerando la pertenencia a determinado linaje definido por espoligotipos como un factor de exposición. Resultados: No se encontró una asociación estadísticamente significativa (valor de ρ >0.05) entre la presencia de al menos un SNP en el gen rpoB y los linajes incluidos en el estudio (LAM, Haarlem, T y Beijing). No obstante, se halló una asociación estadísticamente significativa entre la presencia de al menos un SNP en el gen ponA1 y los linajes LAM y Haarlem (valor de ρ <0.05). Se encontró una asociación entre el SNP P631S del gen ponA1 y los linajes LAM y Haarlem; y el SNP A516T, de este mismo gen, presentó una asociación con el linaje LAM. Asimismo, se halló una asociación entre la resistencia a rifampicina y el linaje LAM. Conclusiones: La presencia de SNPs en el gen ponA1 está asociada con los linajes LAM y Haarlem.
RESUMO
RESUMEN El eugenol es un fenilpropanoide con potencial farmacológico, este estudio determinó teóricamente las propiedades fisicoquímicas del eugenol y derivados. Se encontró que estos cumplen con las reglas de cinco de Lipinski, lo que los posiciona como posibles fármacos. Asimismo, se estudió la reactividad de estas moléculas frente al citocromo P450 y en microorganismos aeróbicos. Utilizando programas de acceso libre se encontró que estas reacciones se dan, principalmente, en los átomos de carbono 1, 2, 3 y 7. Por último, se encontró una correlación entre el desplazamiento químico del 1H RMN y la energía de activación de los átomos de carbono.
SUMMARY Eugenol is a phenylpropanoid with pharmacological potential, this study theoretically determined the physicochemical properties of eugenol and derivatives. It was found that they comply with the Lipinski's rule of five, which positions them as possible drugs. Likewise, the reactivity of these molecules against cytochrome P450 and in aerobic microorganisms was studied. Using free access software, it was found that these reactions occur mainly in the carbon atoms 1, 2, 3 and 7. Finally, a correlation was found between the chemical shift of 1H NMR and the activation energy of the carbon atoms.